Η ύπαρξη υπερβολικής τριχοφυΐας ή ακμής δεν σημαίνει απαραιτήτως ότι η γυναίκα πάσχει από σύνδρομο πολυκυστικών ωοθηκών. Μπορεί να οφείλεται σε άλλες ορμονικές διαταραχές, οι οποίες πρέπει να διερευνώνται.
Η θεραπευτική αντιμετώπιση των πολυκυστικών ωοθηκών είναι πολυπαραγοντική και πολυεπίπεδη. Όσον αφορά τη διαταραχή της ωοθυλακιορρηξίας και τη ρύθμιση της περιόδου, η ενδεδειγμένη θεραπεία είναι η ορμονική, με τη λήψη αντισυλληπτικών, η οποία βοηθά παράλληλα και στην αντιμετώπιση της τριχοφυΐας και της ακμής. Η αποτελεσματικότητα της ορμονικής θεραπείας είναι όμως αμφισβητούμενη, καθώς τα συμπτώματα επανέρχονται με τη διακοπή της. Η αντιμετώπιση των πολυκυστικών ωοθηκών μπορεί να γίνει και λαπαροσκοπικά, με το λεγόμενο drilling των ωοθηκών, μέθοδος που έχει πολύ καλά αποτελέσματα. Σημαντική είναι και η αντιμετώπιση της παχυσαρκίας, που επιτυγχάνεται με περιορισμό των προσλαμβανόμενων θερμίδων και αύξηση της αερόβιας άσκησης.