Σύμφωνα με το σχέδιο αυτό προβλέπεται η λειτουργία των ακόλουθων ΔΟΥ στα νησιά του Αιγαίου:
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Λέσβου
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Σάμου
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Χίου
• 2 ΔΟΥ στο Νομό Δωδεκανήσων
• 2 ΔΟΥ στο Νομό Κυκλάδων
Αντίστοιχα, προβλέπεται η λειτουργία των ακόλουθων ΔΟΥ στα νησιά του Ιονίου:
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Ζακύνθου
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Κέρκυρας
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Κεφαλληνίας
• 1 ΔΟΥ στο Νομό Λευκάδας
Σημειώνεται ότι η επιλογή των ΔΟΥ έγινε σύμφωνα με οικονομικά και διοικητικά κριτήρια που παρουσιάστηκαν στο Πόρισμα της αρμόδιας Επιτροπής του Υπουργείου Οικονομικών στις 30/9/2012.